1999年（平成11年）2月に性同一性障害者が直面する社会的な課題や医療的なサポートの必要性を訴えるため「TSとTGを支える人々の会（Trans-Net Japan）」が設立。
当時、日本には性同一性障害者のための公的な支援制度や自助グループが存在せず、当事者たちは孤立した状況に置かれていました。この団体は、トランスジェンダーの方々の人権を守り、社会的理解を深めることを目的として制定されました。
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この日は性の多様性について考え、理解を深める重要な機会として認識されており、様々な啓発活動やイベントが行われています。トランスジェンダーの方々が自分らしく生きられる社会の実現に向けて、重要な役割を果たしています。
日付は、日本の伝統行事である3月3日の桃の節句（女の子の日）と5月5日の端午の節句（男の子の日）の中間に位置する4月4日が選ばれました。これは性別の二元論にとらわれない、多様な性のあり方を象徴する日として大きな意味を持っています。